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制限酵素のバッファー

制限酵素は適した組成(塩の種類や塩濃度)のバッファーで反応しなければならない。適した組成でない場合、反応速度が低下するだけでなく、塩基の認識が不正確になることもあるので注意しなければいけない(スター活性)。試薬を提供するベンダーによって、バッファーの組成が同一であることもあれば異なる場合もある。主なバッファーとして、NaCl濃度の異なるもの・塩としてKClを用いたもの・塩化物イオンを酢酸イオンにしたものがある。この他、塩濃度を微調節したものやBSAや界面活性剤を添加したものがある。制限酵素によっては、専用のバッファーを使わなければいけないものもある。

各社の類似したバッファー

Buffer chart

低塩濃度バッファー

TakaraL10mM Tris-HCl7.5none10mM MgCl21mM DTT-
日本ジーンL10mM Tris-HCl7.5none10mM MgCl21mM DTT-
NEB110mM Bis-Tris-HCl7.0none10mM MgCl21mM DTT-
FermentasB10mM Tris-HCl7.5none10mM MgCl2-0.1mg/mL BSA
InvitrogenREact150mM Tris-HCl8.0none10mM MgCl2--
PromegaA6mM Tris-HCl7.56mM NaCl6mM MgCl21mM DTT-

中塩濃度バッファー

TakaraM10mM Tris-HCl7.550mM NaCl10mM MgCl21mM DTT-
日本ジーンM10mM Tris-HCl7.550mM NaCl10mM MgCl21mM DTT-
NEB210mM Tris-HCl7.950mM NaCl10mM MgCl21mM DTT-
FermentasG10mM Tris-HCl7.550mM NaCl10mM MgCl2-0.1mg/mL BSA
InvitrogenREact250mM Tris-HCl8.050mM NaCl10mM MgCl2--
PromegaC10mM Tris-HCl7.950mM NaCl10mM MgCl21mM DTT-

高塩濃度バッファー

TakaraH50mM Tris-HCl7.5100mM NaCl10mM MgCl21mM DTT-
日本ジーンH50mM Tris-HCl7.5100mM NaCl10mM MgCl21mM DTT-
NEB350mM Tris-HCl7.9100mM NaCl10mM MgCl21mM DTT-
FermentasO50mM Tris-HCl7.5100mM NaCl10mM MgCl2-0.1mg/mL BSA
InvitrogenREact350mM Tris-HCl8.0100mM NaCl10mM MgCl2--
PromegaE6mM Tris-HCl7.5100mM NaCl6mM MgCl21mM DTT-

KClバッファー

TakaraK20mM Tris-HCl8.5100mM KCl10mM MgCl21mM DTT-
FermentasR10mM Tris-HCl8.5100mM KCl10mM MgCl2-0.1mg/mL BSA
Invitrogen650mM Tris-HCl7.450mM KCl/50mM NaCl6mM MgCl2--
PromegaJ10mM Tris-HCl7.550mM KCl7mM MgCl21mM DTT-

酢酸塩バッファー

TakaraT33mM Tris-OAc7.966mM KOAc10mM MgOAc20.5mM DTT-
日本ジーンA20mM Tris-OAc7.950mM KOAc210mM MgOAc1mM DTT-
NEB420mM Tris-OAc7.950mM KOAc10mM MgOAc21mM DTT-
FermentasY33mM Tris-OAc7.966mM KOAc10mM MgOAc2-0.1mg/mL

各社のバッファー

Takara

タカラバイオ(TaKaRa BIO)

NamePropertybufferpHsaltmetal ionreducer
LLow salt10mM Tris-HCl7.5none10mM MgCl21mM DTT
MMid salt10mM Tris-HCl7.550mM NaCl10mM MgCl21mM DTT
HHigh salt50mM Tris-HCl7.5100mM NaCl10mM MgCl21mM DTT
KKCl salt20mM Tris-HCl8.5100mM KCl10mM MgCl21mM DTT
TTrisOAC33mM Tris-OAc7.966mM KOAc10mM MgOAc20.5mM DTT

日本ジーン

(Nippon gene)

NamePropertybufferpHsaltmetal ionreducer
LLow salt10mM Tris-HCl7.5none10mM MgCl21mM DTT
MMid salt10mM Tris-HCl7.550mM NaCl10mM MgCl21mM DTT
HHigh salt50mM Tris-HCl7.5100mM NaCl10mM MgCl21mM DTT
AAceticacid20mM Tris-OAc7.950mM KOAc10mM MgOAc21mM DTT
BBasic pH10mM Tris-HCl8.5100mM NaCl10mM MgCl21mM DTT

NEB

(New England Biolab)

NamePropertybuffer at 25ºCpHsaltmetal ionreducer
1Low salt10mM Bis-Tris-HCl7.0none10mM MgCl21mM DTT
2Mid salt10mM Tris-HCl7.950mM NaCl10mM MgCl21mM DTT
3High salt50mM Tris-HCl7.9100mM NaCl10mM MgCl21mM DTT
4AcO-salt20mM Tris-OAc7.950mM KOAc10mM MgOAc21mM DTT

Fermentas

NamePropertybufferpHsaltmetal ionreducerother
BlueLow salt10mM Tris-HCl7.5none10mM MgCl2-0.1mg/mL BSA
GreenMid salt10mM Tris-HCl7.550mM NaCl10mM MgCl2-0.1mg/mL BSA
OrangeHigh salt50mM Tris-HCl7.5100mM NaCl10mM MgCl2-0.1mg/mL BSA
RedKCl10mM Tris-HCl8.5100mM KCl10mM MgCl2-0.1mg/mL BSA
YellowAcO-salt33mM Tris-OAc7.966mM KOAc10mM MgOAc2-0.1mg/mL

Invitrogen

NamePropertybufferpHsaltmetal ionreducer(*)other
1Low salt50mM Tris-HCl8.0-10mM MgCl2--
2Mid salt50mM Tris-HCl8.050mM NaCl10mM MgCl2--
3High salt50mM Tris-HCl8.0100mM NaCl10mM MgCl2--
4KCl20mM Tris-HCl7.450mM KCl5mM MgCl2--
6KCl/NaCl50mM Tris-HCl7.450mM KCl/50mM NaCl6mM MgCl2--
7KCl/NaCl50mM Tris-HCl8.050mM KCl/50mM NaCl10mM MgCl2--
8Low salt20mM Tris-HCl7.4-10mM MgCl2--
9High salt100mM Tris-HCl7.6150mM NaCl10mM MgCl2--

(*)10mM DTT別添付

Promega

NamePropertybuffer at 37ºCpHsaltmetal ionreducerother
ALow salt6mM Tris-HCl7.56mM NaCl6mM MgCl21mM DTT-
BMid salt6mM Tris-HCl7.550mM NaCl6mM MgCl21mM DTT-
CMid salt10mM Tris-HCl7.950mM NaCl10mM MgCl21mM DTT-
DHigh salt6mM Tris-HCl7.9150mM NaCl6mM MgCl21mM DTT-
EHigh salt6mM Tris-HCl7.5100mM NaCl6mM MgCl21mM DTT-
FHigh salt10mM Tris-HCl8.5100mM NaCl10mM MgCl21mM DTT-
GBase pH50mM Tris-HCl8.2-5mM MgCl2--
HStrong buffering90mM Tris-HCl7.550mM NaCl10mM MgCl2--
JMid KCl10mM Tris-HCl7.550mM KCl7mM MgCl21mM DTT-
KHigh KCl10mM Tris-HCl7.4150mM KCl10mM MgCl2--
LBase/High salt10mM Tris-HCl9.0100mM NaCl3mM MgCl2--

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