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コドン

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tRNA tRNA 転移RNA (transfer-RNA)。 3つの塩基配列(コドン)とアミノ酸分子を物理的に対応付けるRNA分子。DNAの情報はmRNAに転写され、その配列に相補するtRNAでアミノ酸配列として翻訳される。 References * John G. Arnez and Dino Moras (1999) Transfer RNA. In , , ,
アミノアシルtRNAシンテターゼ アミノアシルtRNAシンテターゼ tRNAはリボソームに達する前にコドンに応じたアミノ酸と結合して準備されてなければいけない。また、コドンとアミノ酸の結合は正確でなければならない。アミノアシルtRNAシンテターゼは、コドンとアミノ酸の適合を担っている重要な酵素である。 , , , ,
カビ・原生動物・脊椎動物・腔腸動物のミトコンドリア、マイコプラズマ・スピロプラズマのコドン表 [no.4] カビ・原生動物・脊椎動物・腔腸動物のミトコンドリア、マイコプラズマ・スピロプラズマのコドン表 [no.4] (The Mold, Protozoan, and Coelenterate Mitochondrial Code and Mycoplasma/Spiroplasma Code) コドン
コドン表 コドン表 * コドン表のデータはThe Genetic Codes (NCBI)を元に作成。 コドンの使用頻度について 同じアミノ酸であっても、コドンの使用頻度は生物種によって異なる。そのため、他の生物を用いて組み換えタンパク質を発現させる場合には、宿主細胞で使用頻度の高いコドンへのサイレント変異を行い、発現量を最適化することができる。 かずさDNA研究所では、各生物種におけるコドン頻度の統計情報を公開している。… ,
バクテリア・植物プラスチドのコドン表 [no.11] バクテリア・植物プラスチドのコドン表 [no.11] (The Bacterial and Plant Platid Code) コドン表11はバクテリア、古細菌、原核ウィルス、葉緑体タンパク質に用いられる。標準コードと同様、開始コドンはAUGが最も翻訳効率が高い。加えて、GUGやUUGによる開始も古細菌やバクテリアで報告されている
ユープロテス目の核のコドン表 [no.10] ユープロテス目の核のコドン表 [no.10] (The Euplotid Nuclear Code) コドン
棘皮動物・扁形動物のミトコンドリアのコドン表 [no.9] 棘皮動物・扁形動物のミトコンドリアのコドン表 [no.9] (The Echinoderm and Flatworm Mitochondrial Code) * 棘皮(きょくひ)動物 * ウニやヒトデなど * 扁形動物 * プラナリアのような非寄生の渦虫綱(Turbellaria)
標準コドン表 [no.1] 標準コドン表 [no.1] (ユニバーサルコドン、The Standard Code) 通常のコドン表で、transl_tableのIDは1である。GenBankのファイル内では、IDが1の場合transl_tableは省略される。標準コドンでない場合に、qualifierとしてCDS feature内に明示される。開始コドンは
無脊椎動物のコドン表 [no.5] 無脊椎動物のコドン表 [no.5] (The Invertebrate Mitochondrial Code) コドン
繊毛虫類・石灰藻類・ヘキサミタ属のコドン表 [no.6] 繊毛虫類・石灰藻類・ヘキサミタ属のコドン表 [no.6] (The Ciliate, Dasycladacean and Hexamita Nuclear Code) コドン
脊椎動物ミトコンドリアのコドン表 [no.2] 脊椎動物ミトコンドリアのコドン表 [no.2] (The Vertebrate Mitochondrial code) 標準コードとの違い Code 2 Standard AGA Ter * Arg R AGG Ter * Arg R AUA Met M Ile I UGA Trp W
酵母の核のコドン表 [no.12] 酵母の核のコドン表 [no.12] (The Alternative Yeast Nuclear Code) 標準コードとの違い Code 12 Standard CUG Ser Leu 開始コドン CAGがCandida albicansで用いられることがある。 範囲 Candida albicans, Candida cylindracea, Candida melibiosica, Candida parapsilosis, Candida rugosa Links * * *
酵母ミトコンドリアのコドン表 [no.3] 酵母ミトコンドリアのコドン表 [no.3] (The Yeast Mitochondrial code) コドン