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ツール集 [2013/01/31 14:38]
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ツール集 [2013/06/09 16:21] (現在)
BioWiki Admin
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 =====コミュニティ===== =====コミュニティ=====
-<float left w200 title(BioUpdate)>​ 
 バイオ研究者による情報サイト。 バイオ研究者による情報サイト。
 [[http://​bioupdate.jp:​8080/​|{{bio:​bioupdate_logo.jpg}}]]\\ ​ [[http://​bioupdate.jp:​8080/​|{{bio:​bioupdate_logo.jpg}}]]\\ ​
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   *[[http://​bioupdate.jp/​pligg|ソーシャルブックマーク]]   *[[http://​bioupdate.jp/​pligg|ソーシャルブックマーク]]
   *[[http://​bioupdate.jp:​8080/​pages/​viewpage.action?​pageId=5144588|口コミレポート]]   *[[http://​bioupdate.jp:​8080/​pages/​viewpage.action?​pageId=5144588|口コミレポート]]
-</​float>​ +
-<float left w200>+
 **[[http://​www.kenkyuu.net/​|研究留学ネット]]** **[[http://​www.kenkyuu.net/​|研究留学ネット]]**
   *[[http://​www.kenkyuu.net/​cgi-forum/​wforum.cgi|研究留学フォーラム]](掲示板)   *[[http://​www.kenkyuu.net/​cgi-forum/​wforum.cgi|研究留学フォーラム]](掲示板)
-</​float>​ 
-<​clear/>​ 
  
  
  
 =====制限酵素ツール===== =====制限酵素ツール=====
-<float icon(dna_scissors)>​ 
   *[[http://​www.neb.com/​nebecomm/​default.asp|New England BioLabs(英語サイト)]]   *[[http://​www.neb.com/​nebecomm/​default.asp|New England BioLabs(英語サイト)]]
   *[[http://​tools.neb.com/​NEBcutter2/​index.php|NEBcutter v2.0]] 制限酵素サイトを表示できる。   *[[http://​tools.neb.com/​NEBcutter2/​index.php|NEBcutter v2.0]] 制限酵素サイトを表示できる。
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   *[[http://​www.matsubarase.com/​enzyme_navi/​index.php|制限酵素ナビ(日本語サイト)]] 制限酵素の検索、バッファーや価格などの情報を提供。   *[[http://​www.matsubarase.com/​enzyme_navi/​index.php|制限酵素ナビ(日本語サイト)]] 制限酵素の検索、バッファーや価格などの情報を提供。
     *[[http://​www.matsubarase.com/​draw_plasmid/​index.php|Web上でのプラスミド描画]]ツールも提供している。     *[[http://​www.matsubarase.com/​draw_plasmid/​index.php|Web上でのプラスミド描画]]ツールも提供している。
-</​float>​ 
-<​clear/>​ 
  
 =====系統樹の描画===== =====系統樹の描画=====
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 {{ bio:​plasmap25_1197849057936.png?​200}} {{ bio:​plasmap25_1197849057936.png?​200}}
 このツールを使うと、本当に簡単に作図できます。たとえば、右の図はpUC19の配列**だけ**を入力し、「Graphic Map」ボタンを押しただけです・・ (クリックすると拡大) このツールを使うと、本当に簡単に作図できます。たとえば、右の図はpUC19の配列**だけ**を入力し、「Graphic Map」ボタンを押しただけです・・ (クリックすると拡大)
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-<​clear/>​ 
  
 =====RNAやDNAの構造===== =====RNAやDNAの構造=====
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 =====化学構造描画ソフト===== =====化学構造描画ソフト=====
-<float icon(molecule)>​ 
 化学構造を表示出来るソフトウェア。 化学構造を表示出来るソフトウェア。
  
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   *[[http://​hossy.net/​chemul/​]]   *[[http://​hossy.net/​chemul/​]]
 日本の方が開発された、化学構造を閲覧できるプログラムで、__Flashで閲覧できる__ところが特徴的。上記サイトで、アミノ酸などの多くの有機分子を閲覧できます。 日本の方が開発された、化学構造を閲覧できるプログラムで、__Flashで閲覧できる__ところが特徴的。上記サイトで、アミノ酸などの多くの有機分子を閲覧できます。
-</​float>​ 
-<​clear/>​ 
  
 =====画像・作図ソフト===== =====画像・作図ソフト=====
 ====GIMP==== ====GIMP====
-<float right> 
 [[computer:​GIMP|{{computer:​en:​gimp_2.13_ubuntu.png?​150|}}]] [[computer:​GIMP|{{computer:​en:​gimp_2.13_ubuntu.png?​150|}}]]
 \\ {{icon>​commons}} \\ {{icon>​commons}}
-</​float>​ 
  
 オープンソースで開発が続けられているフリーの画像処理ソフト。Adobe Photoshopのように、画像を加工するために使います。Windows版・Macintosh版・Linux版が開発されています。 オープンソースで開発が続けられているフリーの画像処理ソフト。Adobe Photoshopのように、画像を加工するために使います。Windows版・Macintosh版・Linux版が開発されています。
   *[[http://​www.gimp.org/​|GIMPホームページ(英語)]]   *[[http://​www.gimp.org/​|GIMPホームページ(英語)]]
- 
-<​clear/>​ 
  
  
 =====ネットワーク可視化/解析ソフト===== =====ネットワーク可視化/解析ソフト=====
-<float right>{{bio:​cytoscape_25_1.jpg?​150|}}</​float>​+{{bio:​cytoscape_25_1.jpg?​150|}}
 ====Cytoscape==== ====Cytoscape====
   *[[Cytoscape]]は、ネットワークの描画/​解析をするためのオープンソースソフトです。多くの論文で使われています。   *[[Cytoscape]]は、ネットワークの描画/​解析をするためのオープンソースソフトです。多くの論文で使われています。
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 =====ライフサイエンス辞書===== =====ライフサイエンス辞書=====
-<float icon(books)>​ 
 [[http://​wwwsoc.nii.ac.jp/​lsdproject/​ja/​service/​weblsd/​index.html|ライフサイエンス辞書(WebLSD)]]は、京都大学のライフサイエンス辞書プロジェクトが作成、公開している生命科学用辞書。 [[http://​wwwsoc.nii.ac.jp/​lsdproject/​ja/​service/​weblsd/​index.html|ライフサイエンス辞書(WebLSD)]]は、京都大学のライフサイエンス辞書プロジェクトが作成、公開している生命科学用辞書。
 実際に論文に使われている例文で確認できるので、論文作成にとても便利。 実際に論文に使われている例文で確認できるので、論文作成にとても便利。
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   ***[[http://​lsd-project.jp/​ja/​service/​etoj/​index.html|E to J]]** : 専門用語の単語訳を行うツール。   ***[[http://​lsd-project.jp/​ja/​service/​etoj/​index.html|E to J]]** : 専門用語の単語訳を行うツール。
   ***[[http://​lsd-project.jp/​ja/​service/​webspell/​index.html|Web spell]]** : 一般語+専門用語のスペルチェック。   ***[[http://​lsd-project.jp/​ja/​service/​webspell/​index.html|Web spell]]** : 一般語+専門用語のスペルチェック。
-</​float>​ 
-<​clear/>​ 
  
 ====教材==== ====教材====
-<float left300> 
 **耳で覚えるライフサイエンス英語2000**\\ ​ **耳で覚えるライフサイエンス英語2000**\\ ​
 WebLSDの音声版がフリーウェアとして公開されている。iTunes や iPod で生命科学の英語,​訳語,​音声を勉強できる WebLSDの音声版がフリーウェアとして公開されている。iTunes や iPod で生命科学の英語,​訳語,​音声を勉強できる
   *[[http://​www.vector.co.jp/​soft/​data/​edu/​se379774.html|ベクターのサイト]]   *[[http://​www.vector.co.jp/​soft/​data/​edu/​se379774.html|ベクターのサイト]]
-</​float>​ +
-<float left300>+
 **オンデマンド英語教材**\\ ​ **オンデマンド英語教材**\\ ​
 500語程度の生命科学に関連した記事を毎週更新。 500語程度の生命科学に関連した記事を毎週更新。
   *[[http://​lsd.pharm.kyoto-u.ac.jp/​ja/​service/​ondemand/​index.html|オンデマンド英語教材]] (WebLSDサイト)   *[[http://​lsd.pharm.kyoto-u.ac.jp/​ja/​service/​ondemand/​index.html|オンデマンド英語教材]] (WebLSDサイト)
-</​float>​+
 ===ライフサイエンス用語変換辞書=== ===ライフサイエンス用語変換辞書===
-<float left300> 
 **ライフサイエンス用語かな漢字変換辞書** **ライフサイエンス用語かな漢字変換辞書**
   *[[http://​www.vector.co.jp/​soft/​dl/​winnt/​writing/​se389421.html|WindowsのMS-IME用]] (Vector,​フリー)   *[[http://​www.vector.co.jp/​soft/​dl/​winnt/​writing/​se389421.html|WindowsのMS-IME用]] (Vector,​フリー)
   *[[http://​www.vector.co.jp/​soft/​dl/​mac/​writing/​se389554.html|Macのことえり用]] (Vector,​フリー)   *[[http://​www.vector.co.jp/​soft/​dl/​mac/​writing/​se389554.html|Macのことえり用]] (Vector,​フリー)
-</​float>​ +
-<float left300>+
 **ライフサイエンス用語かな漢字変換辞書plus** **ライフサイエンス用語かな漢字変換辞書plus**
   *[[http://​www.vector.co.jp/​soft/​winnt/​writing/​se440303.html|WindowsのMS-IME用]]\\ (Vector,​シェア2,​000円)   *[[http://​www.vector.co.jp/​soft/​winnt/​writing/​se440303.html|WindowsのMS-IME用]]\\ (Vector,​シェア2,​000円)
-</​float>​ 
 ====製品・書籍==== ====製品・書籍====
   *[[http://​www.atok.com/​option/​science/​index.html|ライフサイエンス辞書 for ATOK]]   *[[http://​www.atok.com/​option/​science/​index.html|ライフサイエンス辞書 for ATOK]]
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 ======リンク====== ======リンク======
-<float icon(compass)>​ 
   *[[http://​biotools.blogspot.com/​index.html|バイオ最新ツール]]\\ BioAssociatesが提供する製品情報。機器や消耗品、ソフトウェアなど。   *[[http://​biotools.blogspot.com/​index.html|バイオ最新ツール]]\\ BioAssociatesが提供する製品情報。機器や消耗品、ソフトウェアなど。
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 {{tag>​index リンク}} {{tag>​index リンク}}