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制限酵素

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AatII AatII 認識サイト [GACGTC] 反応温度 37 ºC バッファーLowMidHighAcKCl ≥75% X X X O X リンク * 制限酵素 * 制限酵素のバッファー * REBASE 制限酵素 3_突出 ,
AccI AccI 認識サイト [GTMKAC] 反応温度 37 ºC バッファーLowMidHighAcKCl ≥75% X X X O X * GTATAC/GTCGAC * M,K リンク * 制限酵素 * HincII * SalI * 制限酵素のバッファー * REBASE 制限酵素 5_突出 ,
AluI AluI 認識サイト [AGCT] 反応温度 37 ºC バッファーLowMidHighAcKCl ≥75% X O X O X リンク * 制限酵素 * 制限酵素のバッファー * REBASE 制限酵素 平滑 ,
ApaI ApaI 認識サイト [GGGCCC] 反応温度 25 ºC バッファーLowMidHighAcKCl ≥75% O X X O X リンク * 制限酵素 * 制限酵素のバッファー * REBASE 制限酵素 3_突出 非37_c反応 , ,
AvaI AvaI 認識サイト [CYCGRG] 反応温度 37 ºC バッファーLowMidHighAcKCl ≥75% X X X O X * CTCGAG / CCCGGG * R,Y リンク * 制限酵素 * SmaI * 制限酵素のバッファー * REBASE 制限酵素 5_突出 ,
AvaII AvaII 認識サイト [GGWCC] 反応温度 37 ºC バッファーLowMidHighAcKCl ≥75% X X X O X * GGACC / GGTCC * W リンク * 制限酵素 * 制限酵素のバッファー * 制限酵素テンプレート * REBASE 制限酵素 5_突出 ,
BamHI BamHI 認識サイト [GGATCC] 反応温度 37 ºC バッファーLowMidHighAcKCl ≥75% X O X X X リンク * 制限酵素 * M.BamHI * 制限酵素のバッファー * REBASE 制限酵素 5_突出 ,
BsmI BsmI 認識サイト [GAATGCN] 反応温度 65 ºC バッファーLowMidHighAcKCl ≥75% O O O X X * Origin:Bacillus stearothermophilus NUB36 リンク * 制限酵素 * 制限酵素のバッファー * REBASE 制限酵素 3_突出 非37_c反応 , ,
BstEII BstEII 認識サイト [GGTNACC] 反応温度 60 ºC バッファーLowMidHighAcKCl ≥75% X X X O X * 塩基N * Origin: Bacillus stearothermophilus ET リンク * 制限酵素 * 制限酵素のバッファー * REBASE 制限酵素 5_突出 非37_c反応 , ,
DpnI DpnI DpnIは、塩基配列が「GATC」かつ、アデニンがメチル化されている場合にのみ切断する。 認識サイト [GmATC] 反応温度 37 ºC バッファーLowMidHighAcKCl ≥75% X X X O X 反応 下に示した2つの配列は、dam/dcmメチラーゼ処理されたpUC19とメチル化されていないpUC19である。 , ,
DpnII DpnII 認識サイト [GATC] 反応温度 37 ºC バッファーLowMidHighAcKCl ≥75% X X X X X リンク * 制限酵素 * MboI * DpnI * Sau3AI * 制限酵素のバッファー * REBASE 制限酵素 5_突出 ,
DraI DraI 認識サイト [TTTAAA] 反応温度 37 ºC バッファーLowMidHighAcKCl ≥75% X O X O X リンク * 制限酵素 * 制限酵素のバッファー * REBASE 制限酵素 平滑 ,
EcoRI EcoRI 認識サイト [GAATTC] 反応温度 37 °C バッファーLowMidHighAcKCl ≥75% O O O O X リンク * 制限酵素 * M.EcoRI * 制限酵素のバッファー * REBASE 制限酵素 5_突出 ,
HaeII HaeII 認識サイト [RGCGCY] 反応温度 37 °C バッファーLowMidHighAcKCl ≥75% X O X O X * GGCGCC/AGCGCT * 塩基R,Y リンク * 制限酵素 * 制限酵素のバッファー * REBASE 制限酵素 3_突出 ,
HhaI HhaI 認識サイト [GCGC] 反応温度 37 °C バッファーLowMidHighAcKCl ≥75% X O O O X リンク * 制限酵素 * 制限酵素のバッファー * REBASE 制限酵素 3_突出 ,
HincII HincII 認識サイト [GTCGAC] 反応温度 37 ºC バッファーLowMidHighAcKCl ≥75% X O O O X * GTCGAC リンク * 制限酵素 * SalI * AccI * 制限酵素のバッファー * REBASE 制限酵素 平滑 ,
HindIII HindIII 認識サイト [AAGCTT] 反応温度 37 °C バッファーLowMidHighAcKCl ≥75% X O X X X リンク * 制限酵素 * 制限酵素のバッファー * REBASE 制限酵素 5_突出 ,
KpnI KpnI 認識サイト [GGTACC] 反応温度 37 °C バッファーLowMidHighAcKCl ≥75% O X X O X リンク * 制限酵素 * 制限酵素のバッファー * 制限酵素テンプレート * REBASE 制限酵素 3_突出 ,
MboI MboI 認識サイト [GATC] 反応温度 37 ºC バッファーLowMidHighAcKCl ≥75% X O O O O イソシゾマー Sau3AI Sau3AIはMboIのイソシゾマー。MboIはメチル化サイトを切断できないが、Sau3AIはメチル化サイトも切断できるため、ゲノムDNAの部分消化にSau3AIが用いられることがある。 ,
MspA1I MspA1I 認識サイト [CMGCKG] 反応温度 37 °C バッファーLowMidHighAcKCl ≥75% X X X O X * CAGCTG / CCGCGG * 塩基M,K リンク * 制限酵素 * 制限酵素のバッファー * REBASE 制限酵素 平滑 ,
NarI NarI 認識サイト [GGCGCC] 反応温度 37 °C バッファーLowMidHighAcKCl ≥75% O X X X X リンク * 制限酵素 * 制限酵素のバッファー * REBASE 制限酵素 5_突出 ,
NdeI NdeI 認識サイト [CATATG] 反応温度 37 °C バッファーLowMidHighAcKCl ≥75% X X O O X リンク * 制限酵素 * 制限酵素のバッファー * 制限酵素テンプレート * REBASE 制限酵素 5_突出 ,
NsiI NsiI 認識サイト [ATGCAT] 反応温度 37 ºC バッファーLowMidHighAcKCl ≥75% X X O X X リンク * 制限酵素 * 制限酵素のバッファー * REBASE 制限酵素 3_突出 ,
PstI PstI PstI -> PSTI -> 制限酵素PstI 認識サイト [CTGCAG] 反応温度 37 ºC バッファーLowMidHighAcKCl ≥75% X X O X X リンク * 制限酵素 * 制限酵素のバッファー * REBASE 膵分泌性トリプシンインヒビター トリプシンインヒビターはトリプシンに結合して分解活性を抑制する。 , ,
PvuI PvuI 認識サイト [CGATCG] 反応温度 37 °C バッファーLowMidHighAcKCl ≥75% X X O X O with BSA リンク * 制限酵素 * 制限酵素のバッファー * REBASE 制限酵素 3_突出 ,
PvuII PvuII 認識サイト [CAGCTG] 反応温度 37 ºC バッファーLowMidHighAcKCl ≥75% O O O X O リンク * 制限酵素 * AluI * MspA1I * 制限酵素のバッファー * REBASE 制限酵素 平滑 ,
RsaI RsaI 認識サイト [GTAC] 反応温度 37 °C バッファーLowMidHighAcKCl ≥75% O O X O X リンク * 制限酵素 * 制限酵素のバッファー * REBASE 制限酵素 平滑 ,
SacI SacI 認識サイト [GAGCTC] 反応温度 37 °C バッファーLowMidHighAcKCl ≥75% O X X O X リンク * 制限酵素 * 制限酵素のバッファー * REBASE 制限酵素 3_突出 ,
SalI SalI 認識サイト [GTCGAC] 反応温度 37 °C バッファーLowMidHighAcKCl ≥75% X X O X X リンク * 制限酵素 * HincII * AccI * TaqI * 制限酵素のバッファー * REBASE 制限酵素 5_突出 ,
Sau3AI Sau3AI 認識サイト [GATC] 反応温度 37 ºC バッファーLowMidHighAcKCl ≥75% O O O O X イソシゾマー MboI Sau3AIはMboIのイソシゾマー。MboIはメチル化サイトを切断できないが、Sau3AIはメチル化サイトも切断できるため、ゲノムDNAの部分消化にSau3AIが用いられることがある。 ,
ScaI ScaI 認識サイト [AGTACT] 反応温度 37 °C バッファーLowMidHighAcKCl ≥75% o o O X X リンク * 制限酵素 * 制限酵素のバッファー * REBASE 制限酵素 平滑 ,
SmaI SmaI 認識サイト [CCCGGG] 反応温度 25 ºC バッファーLowMidHighAcKCl ≥75% X O O O X リンク * 制限酵素 * AvaI * 制限酵素のバッファー * REBASE 制限酵素 平滑 非37_c反応 , ,
SphI SphI 認識サイト [GCATGC] 反応温度 37 °C バッファーLowMidHighAcKCl ≥75% O O X O X リンク * 制限酵素 * 制限酵素のバッファー * REBASE 制限酵素 3_突出 ,
SspI SspI 認識サイト [AATATT] 反応温度 37 °C バッファーLowMidHighAcKCl ≥75% X o X X X リンク * 制限酵素 * 制限酵素のバッファー * REBASE 制限酵素 平滑 ,
StuI StuI 認識サイト [AGGCCT] 反応温度 37 °C バッファーLowMidHighAcKCl ≥75% o O X o X リンク * 制限酵素 * 制限酵素のバッファー * REBASE 制限酵素 平滑 ,
TaqI TaqI 認識サイト [TCGA] 反応温度 65 ºC バッファーLowMidHighAcKCl ≥75% X X O O X * Origin: Thermus aquaticus YTI リンク * 制限酵素のバッファー * REBASE 制限酵素 5_突出 非37_c反応 , ,
XbaI XbaI 認識サイト [TCTAGA] 反応温度 37 °C バッファーLowMidHighAcKCl ≥75% X O X X X リンク * 制限酵素 * 制限酵素のバッファー * REBASE 制限酵素 5_突出 ,
オーバーハング オーバーハング 上部が下部よりせり出した構造のこと。分子生物学では、dsDNAやdsRNAの突出している部分、あるいは突出している部分の配列をオーバーハングと呼ぶ。 Image 実験での利用 たとえば、ベクターとインサートを ,
スター活性 スター活性 至適でない条件下において、制限酵素の基質特異性が変化したり特異性がゆるんだりすることがある。この変化した特異性における反応性をスター活性(star activity)と呼ぶ。「スター」の由来は
メチラーゼ メチラーゼ (Methylase, Methyltransferase, MTase) 大腸菌などのバクテリアにおける制限修飾系(Restriction and modification system)として知られる酵素のうち、メチル化修飾を行う酵素。遺伝子工学実験で用いられるのは、核酸の特定の塩基配列を認識し、特定部位をメチル化するTypeIIの制限修飾系メチラーゼである。 , ,
制限修飾系 制限修飾系 (Restriction and modification system type I, type I R-M system) 大腸菌に代表されるバクテリアの制限修飾系。ファージからの感染を防ぐためのシステム。EcoKIやEcoBIなど。菌のゲノム上の特定の配列をメチラーゼで修飾(メチル化)し、メチル化されていない外来遺伝子を制限(切断)することによって外来遺伝子からゲノムを守る。 , , ,
制限酵素 制限酵素 バクテリア(細菌)は、常にバクテリオファージ(バクテリオファージφX174など)の攻撃にさらされている。それらから身を守るために、バクテリアの多くの種は外から入ってきたDNAを切ることでバクテリオファージを攻撃する方法を編み出してきた。 , , , ,
制限酵素のバッファー 制限酵素のバッファー 制限酵素は適した組成(塩の種類や塩濃度)のバッファーで反応しなければならない。適した組成でない場合、反応速度が低下するだけでなく、塩基の認識が不正確になることもあるので注意しなければいけない( ,