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5'突出末端

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AccI AccI 認識サイト [GTMKAC] 反応温度 37 ºC バッファーLowMidHighAcKCl ≥75% X X X O X * GTATAC/GTCGAC * M,K リンク * 制限酵素 * HincII * SalI * 制限酵素のバッファー * REBASE 制限酵素 5_突出 ,
AvaI AvaI 認識サイト [CYCGRG] 反応温度 37 ºC バッファーLowMidHighAcKCl ≥75% X X X O X * CTCGAG / CCCGGG * R,Y リンク * 制限酵素 * SmaI * 制限酵素のバッファー * REBASE 制限酵素 5_突出 ,
AvaII AvaII 認識サイト [GGWCC] 反応温度 37 ºC バッファーLowMidHighAcKCl ≥75% X X X O X * GGACC / GGTCC * W リンク * 制限酵素 * 制限酵素のバッファー * 制限酵素テンプレート * REBASE 制限酵素 5_突出 ,
BamHI BamHI 認識サイト [GGATCC] 反応温度 37 ºC バッファーLowMidHighAcKCl ≥75% X O X X X リンク * 制限酵素 * M.BamHI * 制限酵素のバッファー * REBASE 制限酵素 5_突出 ,
BstEII BstEII 認識サイト [GGTNACC] 反応温度 60 ºC バッファーLowMidHighAcKCl ≥75% X X X O X * 塩基N * Origin: Bacillus stearothermophilus ET リンク * 制限酵素 * 制限酵素のバッファー * REBASE 制限酵素 5_突出 非37_c反応 , ,
DpnII DpnII 認識サイト [GATC] 反応温度 37 ºC バッファーLowMidHighAcKCl ≥75% X X X X X リンク * 制限酵素 * MboI * DpnI * Sau3AI * 制限酵素のバッファー * REBASE 制限酵素 5_突出 ,
EcoRI EcoRI 認識サイト [GAATTC] 反応温度 37 °C バッファーLowMidHighAcKCl ≥75% O O O O X リンク * 制限酵素 * M.EcoRI * 制限酵素のバッファー * REBASE 制限酵素 5_突出 ,
HindIII HindIII 認識サイト [AAGCTT] 反応温度 37 °C バッファーLowMidHighAcKCl ≥75% X O X X X リンク * 制限酵素 * 制限酵素のバッファー * REBASE 制限酵素 5_突出 ,
MboI MboI 認識サイト [GATC] 反応温度 37 ºC バッファーLowMidHighAcKCl ≥75% X O O O O イソシゾマー Sau3AI Sau3AIはMboIのイソシゾマー。MboIはメチル化サイトを切断できないが、Sau3AIはメチル化サイトも切断できるため、ゲノムDNAの部分消化にSau3AIが用いられることがある。 ,
NarI NarI 認識サイト [GGCGCC] 反応温度 37 °C バッファーLowMidHighAcKCl ≥75% O X X X X リンク * 制限酵素 * 制限酵素のバッファー * REBASE 制限酵素 5_突出 ,
NdeI NdeI 認識サイト [CATATG] 反応温度 37 °C バッファーLowMidHighAcKCl ≥75% X X O O X リンク * 制限酵素 * 制限酵素のバッファー * 制限酵素テンプレート * REBASE 制限酵素 5_突出 ,
SalI SalI 認識サイト [GTCGAC] 反応温度 37 °C バッファーLowMidHighAcKCl ≥75% X X O X X リンク * 制限酵素 * HincII * AccI * TaqI * 制限酵素のバッファー * REBASE 制限酵素 5_突出 ,
Sau3AI Sau3AI 認識サイト [GATC] 反応温度 37 ºC バッファーLowMidHighAcKCl ≥75% O O O O X イソシゾマー MboI Sau3AIはMboIのイソシゾマー。MboIはメチル化サイトを切断できないが、Sau3AIはメチル化サイトも切断できるため、ゲノムDNAの部分消化にSau3AIが用いられることがある。 ,
TaqI TaqI 認識サイト [TCGA] 反応温度 65 ºC バッファーLowMidHighAcKCl ≥75% X X O O X * Origin: Thermus aquaticus YTI リンク * 制限酵素のバッファー * REBASE 制限酵素 5_突出 非37_c反応 , ,
XbaI XbaI 認識サイト [TCTAGA] 反応温度 37 °C バッファーLowMidHighAcKCl ≥75% X O X X X リンク * 制限酵素 * 制限酵素のバッファー * REBASE 制限酵素 5_突出 ,
末端の平滑化 末端の平滑化 核酸の突出末端は酵素によって平滑末端にすることができる。酵素によって平滑化後の配列が変わることがあるので注意。 突出末端を平滑化するには、次のような酵素活性を利用する。 , , ,